Giardia duodenalis and Cryptosporidium spp. are gastro-intestinal protozoa known to infect small ruminants. Both protozoa are also considered as a potential public health concern. The objective of this study was to determine their prevalence in lambs and goat kids kept under common Mediterranean dairy husbandry systems and to identify the species and genotypes infecting these small ruminants. In total, 684 faecal samples (429 from lambs and 255 from goat kids) were collected on 21 farms in Greece and examined using a quantitative immunofluorescence assay. G. duodenalis was detected in 37.3% of the lambs and 40.4% of the goat kids. On all but one of the farms G. duodenalis was detected. Most samples were typed as a mono-infection with G. duodenalis assemblage E, both on the β-giardin gene and the triose phosphate isomerase gene. Only 10% of samples were typed as mixed assemblage A and E infections. The prevalence of Cryptosporidium spp. was 5.1% in lambs and 7.1% in goat kids. In total, 8 out of the 14 farms with a sheep flock and 7 out of the 14 farms with a goat flock were positive. Cryptosporidium parvum (subtype IId), C. ubiquitum and C. xiaoi were identified, the latter especially in goat kids. In conclusion, the results of the present study illustrate that G. duodenalis and Cryptosporidium spp. occur frequently on both sheep and goats farms. The prevalence of zoonotic genotypes or species was low, indicating a limited but existing risk for zoonotic infections.
Giardia duodenalis et Cryptosporidium spp. sont des protozoaires gastro-intestinaux connus pour infecter les petits ruminants. Les deux protozoaires sont également considérés comme un risque potentiel pour la santé publique. L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence chez les agneaux et les chevreaux élevés dans les systèmes méditerranéens communs d’élevage laitier et d’identifier les espèces et les génotypes infectant ces petits ruminants. Au total, 684 échantillons fécaux (429 provenant d’agneaux et 255 de chevreaux) ont été collectés dans 21 exploitations en Grèce et examinés à l’aide d’un test quantitatif d’immunofluorescence. G. duodenalis a été détecté chez 37.3 % des agneaux et 40.4 % des chevreaux, dans toutes les fermes sauf une. La plupart des échantillons ont été typés comme une mono infection par l’assemblage E de G. duodenalis, en se fondant à la fois sur l’identification du gène de la β-giardine ou du gène de l’isomérase de triose phosphate. Seuls 10 % des échantillons ont été identifiés comme une combinaison d’infections par les assemblages A et E. La prévalence de Cryptosporidium spp. était de 5.1 % chez les agneaux et de 7.1 % chez les chevreaux. Au total, 8 des 14 fermes ovines et 7 des 14 fermes caprines étaient positives. Cryptosporidium parvum (sous-type IId), C. ubiquitum et C. xiaoi ont été identifiés, ce dernier en particulier chez les chevreaux. En conclusion, les résultats de cette étude montrent que G. duodenalis et Cryptosporidium spp. sont fréquemment présents chez les ovins et les caprins. La prévalence des génotypes ou espèces zoonotiques était faible, ce qui indique un risque limité bien que présent pour des infections zoonotiques.
N. Tzanidakis et al., published by EDP Sciences, 2014