Comparison of a semiautomated commercial repetitive-sequence-based PCR method with spoligotyping, 24-locus mycobacterial interspersed repetitive-unit-variable-number tandem-repeat typing, and restriction fragment length polymorphism-based analysis of IS6110 for Mycobacterium tuberculosis typing

Affiliations

• ¹ AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France [email protected].
• ² Institut de Génétique et Microbiologie, UMR8621 CNRS-Université Paris-Sud 11, UniverSud, Infection Genetics Emerging Pathogens Evolution (IGEPE) Team, Orsay-Cedex, France.
• ³ AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France.
• ⁴ AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France.