Noncontiguous finished genome sequence and description of Nocardioides massiliensis sp. nov. GD13(T)

G Dubourg; S A Sankar; J Rathored; J-C Lagier; C Robert; C Couderc; L Papazian; D Raoult; P-E Fournier

doi:10.1016/j.nmni.2016.01.001

Noncontiguous finished genome sequence and description of Nocardioides massiliensis sp. nov. GD13(T)

New Microbes New Infect. 2016 Jan 9:10:47-57. doi: 10.1016/j.nmni.2016.01.001. eCollection 2016 Mar.

Authors

G Dubourg¹, S A Sankar², J Rathored², J-C Lagier¹, C Robert², C Couderc³, L Papazian⁴, D Raoult⁵, P-E Fournier¹

Affiliations

¹ Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France; Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, University, Hospital Centre Timone, Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France.
² Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
³ Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, University, Hospital Centre Timone, Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France.
⁴ Service de Réanimation Médicale-Détresse Respiratoires et Infections Sévères, Hôpital Nord, Marseille, France.
⁵ Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France; Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, University, Hospital Centre Timone, Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France; Special Infectious Agents Unit, King Fahd Medical Research Center, King Abdul Aziz University, Jeddah, Saudi Arabia.

Abstract

Nocardioides massiliensis sp. nov strain GD13(T) is the type strain of N. massiliensis sp. nov., a new species within the genus Nocardioides. This strain was isolated from the faeces of a 62-year-old man admitted to intensive care for Guillain-Barré syndrome. Nocardioides massiliensis is a strictly aerobic Gram-positive rod. Herein we describe the features of this bacterium, together with the complete genome sequence and annotation. The 4 006 620 bp long genome contains 4132 protein-coding and 47 RNA genes.

Keywords: Culturomics; genome; taxonogenomics.