Draft Genome Sequence of a Chitinophaga Strain Isolated from a Lignocellulose Biomass-Degrading Consortium

Luciano T Kishi; Erica M Lopes; Camila C Fernandes; Gabriela C Fernandes; Lais P Sacco; Lucia M Carareto Alves; Eliana G M Lemos

doi:10.1128/genomeA.01056-16

Draft Genome Sequence of a Chitinophaga Strain Isolated from a Lignocellulose Biomass-Degrading Consortium

Genome Announc. 2017 Jan 19;5(3):e01056-16. doi: 10.1128/genomeA.01056-16.

Authors

Luciano T Kishi¹, Erica M Lopes¹, Camila C Fernandes^{1

2}, Gabriela C Fernandes¹, Lais P Sacco¹, Lucia M Carareto Alves¹, Eliana G M Lemos^{3

2}

Affiliations

¹ Departamento de Tecnologia, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Planta (LBMP), Jaboticabal, São Paulo, Brazil.
² Departamento de Tecnologia, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Laboratório Multiusuário de Sequenciamento em Larga Escala e Expressão Gênica, Jaboticabal, São Paulo, Brazil.
³ Departamento de Tecnologia, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Planta (LBMP), Jaboticabal, São Paulo, Brazil [email protected].

Abstract

Chitinophaga comprises microorganisms capable of degrading plant-derived carbohydrates, serving as a source of new tools for the characterization and degradation of plant biomass. Here, we report the draft genome assembly of a Chitinophaga strain with 8.2 Mbp and 7,173 open reading frames (ORFs), isolated from a bacterial consortium that is able to degrade lignocellulose.