Disease ecology is a rapidly growing subdiscipline, and mammals and their parasites feature prominently in both historical and more recent research efforts. Nevertheless, the diversity of topics explored, and those not well explored, has not been systematically assessed. We conducted a systematic review of the published scientific literature in disease ecology of mammals and subjected the collection of original and review articles identified to a topic modeling approach, which is based on the words used in the published texts and their contexts (i.e., the frequency and strength of their semantic relationships with one another). In addition to concept maps identifying the most prominent research themes, we identified eight (not mutually exclusive) subcategories of studies, including experimental, theoretical, comparative, behavioral, immunological-microbiological, biogeographic-macroecological, vector-focused (e.g., mosquitoes), and disturbance-focused. The most prominent themes arising in review papers included the ecology of zoonotic diseases transmitted from non-human mammals, comparisons of pathogen prevalence between mammalian species, and pathogen discovery-disease surveillance studies, particularly of marine mammals and bats. For the original articles, the most prominent themes included ecology of rodent-transmitted viral and bacterial diseases and the population biology of zoonotic hosts. Most studies used comparative or descriptive approaches to investigate mammal-pathogen-disease relationships at a local scale, focusing on vector-borne diseases. Experimental, modeling, immunological, and behavioral approaches were strikingly underrepresented. Topics of strong conceptual importance, but that are underrepresented in the current literature, include: 1) the effects of the population density of mammalian hosts, and manipulations of density, on pathogen transmission; 2) macroecological studies that quantify effects of mammalian host species on parasite abundance and prevalence; and 3) effects of climate change on physiological and behavioral processes relevant to mammal-parasite interactions.
La ecología de las enfermedades es una subdisciplina en rápido crecimiento, y los mamíferos y sus parásitos ocupan un lugar destacado en los esfuerzos de investigación tanto históricos como en los más recientes. Sin embargo, la diversidad de temas estudiados, y de aquellos que no han sido tan bien explorados, no ha sido evaluada sistemáticamente. Llevamos a cabo una revisión sistemática de la literatura científica publicada respecto a ecología de las enfermedades en mamíferos, y sometimos los artículos originales y revisiones encontradas a un análisis temático basado en las palabras utilizadas en las publicaciones y en el contexto de uso (es decir, la frecuencia y la intensidad de las relaciones semánticas). Además de definir mapas conceptuales que muestran los temas de investigación más destacados, identificamos ocho subcategorías de estudios (no mutuamente excluyentes), que incluyen estudios experimentales, teóricos, comparativos, de comportamiento, inmunológicos-microbiológicos, biogeográficos-macroecológicos, centrados en vectores (por ejemplo, mosquitos), y enfocados en perturbaciones. Los temas más relevantes que surgieron de los artículos de revisión incluyeron la ecología de las enfermedades zoonóticas transmitidas por mamíferos no humanos, las comparaciones de la prevalencia de patógenos entre especies de mamíferos, y los estudios de monitoreo para asociar patógenos y enfermedades, en particular de mamíferos marinos y murciélagos. En los artículos originales, los temas más destacados incluyeron la ecología de las enfermedades virales y bacterianas transmitidas por roedores, y la biología de poblaciones en huéspedes zoonóticos. La mayoría de los estudios utilizaron enfoques comparativos o descriptivos para investigar las relaciones entre mamíferos, patógenos y enfermedades a escala local, centrándose en las enfermedades transmitidas por vectores. Estudios con enfoques experimentales, utilizando modelos matemáticos, o estudios inmunológicos y de comportamiento fueron sorprendentemente más escasos. Los temas de gran importancia conceptual, pero que están poco representados en la literatura actual, incluyen: 1) los efectos de la densidad de la población de los mamíferos hospedadores, y de las manipulaciones de esta densidad, sobre la transmisión de patógenos; 2) estudios macroecológicos que cuantifican los efectos de los mamíferos hospedadores en la abundancia y prevalencia de parásitos; y 3) los efectos del cambio climático en los procesos fisiológicos y de comportamiento relevantes para las interacciones mamífero-parásito.
Keywords: behavioral ecology; content mining; helminth parasites; machine learning; marine disease; vector-borne; zoonosis.