Examination of Blood and Tracheal Aspirate Culture Results in Intensive Care Patients: 5-year analysis

Medeni Med J. 2020;35(2):128-135. doi: 10.5222/MMJ.2020.89138. Epub 2020 Jun 30.

Abstract

Objective: Majority of nosocomial infections are seen in intensive care units (ICUs) and they course with higher rates of mortality, and morbidity rates. In this study, we aimed to investigate the distribution of microorganisms isolated from the tracheal aspirate and blood cultures of ICU hospitalized patients, and their antibiotic resistance profiles.

Method: Tracheal aspirate and blood cultures sent from ICU patients were evaluated retrospectively between 2014-2018. Antimicrobial susceptibility tests were performed on microorganism cultures that were identified by conventional methods and using an automated system.

Results: A total of 23.275 samples were accepted during the study period. The microorganisms isolated from tracheal aspirate cultures were Gram-negative (89.7%), Gram-positive (9.3%) and yeasts (1%). The most common Gram (-) microorganisms were A.baumannii (%25.7). The rates of meropenem resistance were documented as 98.3% for A.baumannii in 2014, 95.7% in 2018, 69.2% for P.aeruginosa. in 2014, and 35.6% in 2018, 45.55 for K.pneumoniae in 2014, and 5.8% in 2018 and 8% for E.coli in 2014, and 2% in 2018. The rates of methicillin resistance in S.aureus were documented as 28.0% in 2018, and 67.7% in 2015. The rates of penicillin resistance for S. pneumonia was documented as 76.8% in 2018, and 13.4% in 2015. The microorganisms isolated from blood culture were Gram (-) (31.4%), Gram (+) (57.9%) and yeasts (10.6%). The most frequently isolated Gram (-) bacteria were K.pneumonia (9.3%) and A.baumannii (8.8%). The rates of meropenem resistance were documented as 97.3% for A.baumannii. in 2014 and 79.2% in 2018, as 76.9% for K.pneumoniae in 2014 and 37.3% in 2018 and 79.2% for P.aeruginosa in 2014 and 26.1% in 2018. The artes of methicillin resistance were documented as 89.2% in 2018, and 78.5% for CNS in 2015, and 42.6% in 2018 while it was 92.4% for S. aureus in 2015.

Conclusions: Our study showcased a drop throughout the year in rates of carbapenem resistance against Gram (-) microorganisms and methicillin resistance in S.aureus. However, the persistently high carbapanem resistance in A.baumannii isolates demonstrates the crucial need to continue with infection control measures.

Amaç: Nozokomiyal enfeksiyonların büyük bir kısmı yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) görülmekte ve yüksek mortalite ve morbidite ile seyretmektedir. Çalışmamızda hastanemiz yoğun bakım ünitesindeki hastaların kan ve trakeal aspirat kütürlerinden izole edilen mikroorganizmaları ve antibiyotik direnç profillerini araştırmayı amaçladık.

Yöntem: Yoğun bakım ünitemizden 2014-2018 yılları arasında gönderilen kan ve trakealaspirat kültürleri retrospektif olarak değerlendirildi. Kültürleri yapıldıktan sonra üreyen mikroorganizmalar konvansiyonel metodlar ve otomatize sistemler ile tanımlandı ve antimikrobiyal duyarlılık testleri yapıldı.

Bulgular: Çalışma sırasında 23.275 örnek kabul edildi. Trakeal aspirat kültürlerinde Gram-negatif bakteri üreme oranı %89,7, Gram-pozitif bakteri üreme oranı %9,3 ve maya üreme oranı %1 olarak bulundu. A. baumannii (%25,7) en yaygın Gram-negatif mikroorganizma idi. Meropenem direnci; A.baumannii’ de 2014 yılında % 98,3, 2018 yılında % 95,7, P.aeruginosa 2014 yılında %69,2, 2018 yılında %36,5 ve E. coli de 2014 de %8, 2018 yılında %2, K.pneumoniae. de 2014’de %45,5, 2018’de %45,8 olarak belirlendi. S.aureus’da metisilin direnci 2015 yılında %67,7 iken 2018 yılında %28 olarak saptandı. S. pneumonia da penisilin direnci 2015’de %13,4 iken 2018’de %76,8 olarak bulundu. Kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmalrın %31.4’ü Gram-negatif bakteri,%57,9’u Gram-pozitif bakteri ve %10,6 maya olarak belirlendi. En sık izole edilen Gram-negatif bakteriler Klebsiella pneumonia (%9,3) ve Acinetobacter baumannii (%8,8) idi. Meropenem direnci; Acinetobacter spp.’de 2014 yılında %97.3 2018 yılında %79,2, Klebsiella spp.’de 2014’de %76,9 2018 de %37,3, Pseudomonas spp’de 2014 yılında %79,2, 2018 yılında %26,1 olarak bulundu. KNS bakterilerde Metisilin direnci 2015’de %78,5 iken 2018’de %89,2, S.aureus’da 2015’de %92,4 iken 2018’de % 42,6, Enterokok cinsi bakterilerde ampisilin direnci 2014 yılında %23, 2018’de %11,7 olarak bulundu.

Sonuç: Çalışmamızda Gram-negatif mikroorganizmalarda karbapenem direnç oranlarında ve Staphylococcus aureus’da metisilin direnç oranlarında yıllar içinde düşme izlenmiştir. Ancak A. baumannii izolatlarında karbapenem direncinin hâlâ yüksek olması enfeksiyon kontrol önlemlerinin ısrarla devam etmesi gerektiğini göstermektedir.

Keywords: Intensive care units; culture; drug resistance.