Introduction: Bastroviruses were discovered in the Netherlands in 2016 in human stool samples and show partial genetic similarities to astroviruses and hepatitis E viruses. Their association with disease onset has not yet been established.
Materials and methods: Metagenomic sequencing of fecal samples of Nyctalus noctula bats collected in the Russian Federation in 2023 was performed. Two almost complete genomes of bastroviruses were assembled. The zoonotic potential of these viruses was assessed using machine learning methods, their recombination was studied, and phylogenetic trees were constructed.
Results: A nearly complete bastrovirus genome was de novo assembled in one of the samples, and it was used to assemble another genome in another sample. The zoonotic potential of the virus from one of these samples was estimated as high. The existence of recombination between structural and non-structural polyproteins was demonstrated.
Conclusion: Two bastrovirus genomes were assembled, phylogenetic and recombination analyses were performed, and the zoonotic potential was evaluated.
Введение. Бастровирусы были обнаружены в Нидерландах в 2016 г. в кале человека. Они демонстрируют частичное генетическое сходство с астровирусами, а также вирусами гепатита Е. Их связь с возникновением заболеваний пока не была установлена. Цель работы. Получение новой генетической информации о бастровирусах, циркулирующих среди летучих мышей на территории России. Материалы и методы. Было проведено метагеномное секвенирование образцов фекалий летучих мышей вида Nyctalus noctula, выловленных на территории РФ в 2023 г. Собрано два почти полных генома бастровирусов. Был оценен зоонозный потенциал данных вирусов методами машинного обучения, изучена их рекомбинация, а также построены филогенетические деревья. Результаты. De novo был собран почти полный геном (длина около 5800 оснований) нового бастровируса в одном из образцов, он был использован как референс для получения другого генома в другом образце. Зоонозный потенциал вируса одного из этих образцов методами машинного обучения был оценен как высокий. Показано существование рекомбинации между структурным и неструктурным полипротеинами. Заключение. Первое обнаружение бастровируса на территории РФ дополняет мировые данные о широте ареала его распространения. Наличие рекомбинации между полипротеинами и высокий зоонозный потенциал вируса подчеркивают важность его дальнейшего изучения.
Keywords: NGS; bastroviruses; bats; metagenomics.