1 Univ Rouen Normandie, Université de Caen Normandie, INSERM, Normandie Univ, DYNAMICURE UMR 1311, CHU Rouen, Department of Virology, F-76000 Rouen, France.
2 Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France; CIRICentre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, F-69007, Lyon, France; GenEPII sequencing platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France.
3 Centre National de Référence Virus des Infections Respiratoire (CNR VIR), M3P, Institut Pasteur Université Paris Cité, Paris, France.
4 Université Paris Cité, Inserm, IAME, F-75018 Paris, France; Service de virologie, AP-HP, Hôpital Bichat-Claude Bernard, F-75018 Paris, France.
5 Service de Virologie, CHU de Bordeaux, Bordeaux, France; Université de Bordeaux, MFP CNRS UMR 5234, Bordeaux, France.
6 Sorbonne Université, INSERM, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Service de Virologie, Paris, France.
7 Microbes Evolution Phylogeny and Infections (MEPHI), Aix-Marseille University (AMU), 19-21 Boulevard Jean Moulin, Marseille, France; IHU Méditerranée Infection, 19-21 Boulevard Jean Moulin, 13005 Marseille, France; Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM), 264 rue Saint-Pierre 13385 Marseille, France.
8 Département de Virologie, Bactériologie, Hygiène et Mycologie-Parasitologie, Centre Hospitalier Universitaire Henri-Mondor, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), Créteil, France; INSERM U955, équipe 18, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Université Paris-Est Créteil (UPEC), Créteil, France.
9 Laboratoire de Virologie et Mycobactériologie, CHU Poitiers, 86021 Poitiers, France.
10 Laboratoire de Virologie CHU REIMS.
11 Virology Department, University of Rennes, CHU Rennes, Inserm, EHESP, Irset (Institut de recherche en santé, environnement et travail), UMR_S 1085, Rennes, France.
12 Laboratoire de Virologie, AP-HP, Hôpital Saint Louis, INSIGHT U976, INSERM, Université Paris Cité, Paris, France.
13 Laboratoire de Biologie Médicale, Hôpital Sainte Musse, Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon La Seyne sur Mer, Toulon, France.
14 Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Toulouse, France.
15 Virology and Emergence Units, Department of Bacteriology, Virology and Hospital Hygiene, University Hospital of Tours, FRANCE; INSERM U1259 MAVIVHe, Tours University, FRANCE.
16 Centre National de Référence Virus des Infections Respiratoire (CNR VIR), M3P, Institut Pasteur Université Paris Cité, Paris, France; M3P, Institut Pasteur, Université Paris-Saclay, Université de Versailles St. Quentin, Université Paris Cité, UMR 1173 (2I), INSERM, 75015 Paris, France; Assistance Publique des Hôpitaux de Paris, 75015 Paris, France.
17 Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France; CIRICentre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, F-69007, Lyon, France; GenEPII sequencing platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France. Electronic address: [email protected].