Env length and N-linked glycosylation following transmission of human immunodeficiency virus Type 1 subtype B viruses

Virology. 2008 May 10;374(2):229-33. doi: 10.1016/j.virol.2008.01.029. Epub 2008 Mar 7.

Abstract

Whether there is selection for specific viral Env variants upon HIV-1 transmission is controversial. We examined the V1V2 and V1V4 regions of Env in 10 new and 8 previously described transmission pairs infected with HIV-1 subtype B, including a total of 9 pairs in which the infecting partner had developed substantial viral diversity prior to transmission. We found that during transmission of HIV-1 subtype B, as well as for other subtypes reported in the past, viral populations in recipients undergo substantial genetic bottlenecks, as well as weak evidence for a propensity to replicate viruses with shorter variable loops and fewer potential N-linked glycosylation sites.

Publication types

  • Research Support, N.I.H., Extramural

MeSH terms

  • Disease Transmission, Infectious
  • Female
  • Gene Products, env* / chemistry
  • Gene Products, env* / genetics
  • Gene Products, env* / metabolism
  • Glycosylation
  • HIV Envelope Protein gp120 / chemistry
  • HIV Envelope Protein gp120 / genetics
  • HIV Envelope Protein gp120 / metabolism
  • HIV Envelope Protein gp160 / chemistry
  • HIV Envelope Protein gp160 / genetics
  • HIV Envelope Protein gp160 / metabolism
  • HIV Infections / transmission*
  • HIV Infections / virology
  • HIV-1 / classification
  • HIV-1 / genetics*
  • HIV-1 / physiology
  • Humans
  • Male
  • Molecular Sequence Data
  • Sequence Analysis, DNA

Substances

  • Gene Products, env
  • HIV Envelope Protein gp120
  • HIV Envelope Protein gp160

Associated data

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