Dermacentor (Indocentor) auratus Supino, 1897 is a prominent ixodid vector of numerous pathogens of public health and veterinary importance. Using long-range PCR of two overlapping regions sequenced on an Illumina MiSeq machine, the complete mitochondrial genome of D. auratus is reported here. The resulting contigs were able to be assembled into a complete and circularised genome which had the general organisation of the mitochondrial genomes of the Metastriates. It had a total length of 14,766 bp and contained 37 genes, including 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, and 2 ribosomal RNA genes, as well as 2 non-coding control regions and 3 tick-boxes. The phylogenetic analysis on the whole mitogenome confirmed the position of D. auratus within the Dermacentor clade.
Title: Le génome mitochondrial complet de Dermacentor (Indocentor) auratus (Acari, Ixodidae).
Abstract: Dermacentor (Indocentor) auratus Supino, 1897 est un ixode, vecteur notable de nombreux pathogènes importants en santé publique et en médecine vétérinaire. Utilisant la PCR en fragment long sur deux régions chevauchantes combinée au séquençage sur une plate-forme Illumina MiSeq, le génome mitochondrial complet de D. auratus est présenté ici. Les contigs obtenus ont été assemblés en un génome circulaire complet conforme à l’organisation générale des génomes mitochondriaux des Métastriates. D’une longueur totale de 14766 pb, il contient 37 gènes, incluant 13 gènes codants des protéines, 22 gènes d’ARN de transfert et 2 gènes d’ARN ribosomaux, ainsi que 2 régions contrôles non-codantes et 3 motifs « tick-box ». L’analyse phylogénétique sur le mitogénome complet confirme la position de D. auratus au sein du clade Dermacentor.
Keywords: Dermacentor (Indocentor) auratus; Illumina sequencing; Long-range PCR; Mitochondrial genome.
© J.-M. Chavatte & S. Octavia, published by EDP Sciences, 2021.