1 Université Clermont Auvergne, Inserm U1071, USC-INRAe 2018, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Auvergne, 28 place Henri Dunant, 63001, Clermont-Ferrand, France. [email protected].
2 Université Clermont Auvergne, Inserm U1071, USC-INRAe 2018, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Auvergne, 28 place Henri Dunant, 63001, Clermont-Ferrand, France.
3 Centre de référence de la résistance aux antibiotiques, Centre Hospitalier Universitaire, 58 place Montalembert, 63000, Clermont-Ferrand, France.
4 Université de Paris, IAME, INSERM, F-75018, Paris, France.
5 AP-HP, Hôpital Bichat, DEBRC, F-75018, Paris, France.
6 Hub de Bioinformatique et Biostatistique-Département Biologie Computationnelle, Institut Pasteur, USR 3756 CNRS, Paris, France.
7 IMOST, UMR 1240 Inserm, Université Clermont Auvergne, 58 Rue Montalembert, 63005, Clermont-Ferrand, France.
8 Université Clermont Auvergne, Inserm U1071, USC-INRAe 2018, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Auvergne, 28 place Henri Dunant, 63001, Clermont-Ferrand, France. [email protected].
9 Centre de référence de la résistance aux antibiotiques, Centre Hospitalier Universitaire, 58 place Montalembert, 63000, Clermont-Ferrand, France. [email protected].