Diferencia entre revisiones de «Carga viral»

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'''Carga viral''' o '''carga vírica''' es la cuantificaccióncuantificación de la infección por [[virus]] que se calcula por estimación de la cantidad de partículas virales en los fluidos corporales, como por ejemplo [[ARN]] viral por mililitros de sangre.
 
La carga viral se usa para control terapéutico de virosis crónicas y control de pacientes inmunosuprimidos como los que han recibido [[trasplante (medicina)]] de órganos o de [[células madre]] hematopoýeticas o de [[médula ósea]].
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En el diagnóstico y tratamiento del [[Virus de la inmunodeficiencia humana|VIH]] la carga viral es la cuantificación de VIH-1 que se encuentra en el [[Plasma sanguíneo|plasma]] o cuantificación del [[ARN|RNA]] vírico que existe en una muestra. El método empleado consiste en técnicas de [[biología molecular]] o de diagnóstico genético, usando la [[reacción en cadena de la polimerasa]].
 
LaPara medir la carga viral resultase utiliza un marcador de la actividad del VIH-1 y junto con la determinación de [[CD4]] miden la competencia del sistema inmune de la persona.
 
La determinación de la carga viral plasmática (CV) del VIH es el marcador de respuesta al tratamiento [[antirretroviral]] más sensible, rápido y fiable. La CV se correlaciona directamente con el pronóstico clínico, el riesgo de transmisión viral y el recuento de [[CD4]]. Es una herramienta básica en el manejo clínico de la persona [[seropositivo|seropositiva]] ya que permite:
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== Carga viral en hepatitis B y C ==
Junto con [[Genotipado|genotipificación]] viral, la detección cuantitativa de RNAARN está indicada en los casos de hepatitis por [[VHB]] y [[VHC]] que serán sometidos a terapia antiviral con el fin de evaluar el pronosticopronóstico y respuesta virológica.
 
Para el pronosticopronóstico se considera que a mayor carga viralvírica basal, menor probabilidad de una respuesta sostenida.
 
La respuesta al tratamiento antiviralantivírico se evalúa con una carga viralvírica basal (pre-tratamientopretratamiento) y al menos una carga viral al término de ésteeste y a las 24 semanas post tratamiento. Se considera una buena respuesta al tratamiento antiviral si se obtiene una carga viral indetectable al término del tratamiento y una carga viral indetectable y/o [[RNAARN]] cualitativo negativo a las 24 semanas (respuesta viralvírica sostenida). Igualmente se ha determinado que una carga viral temprana (respuesta viralvírica precoz), con caída de 2 log 10 o más a las 4 óo 12 semanas intra-tratamiento, permite evaluar precozmente la probabilidad de obtener una respuesta virológica sostenida al término de la terapia.
 
En caso del VHB la carga viralvírica permitirá además, detectar la infección con [[Mutación|mutantes]] pre-core (hasta 40 % en zonas de alta endemia) donde existe ausencia de antígeno e ([[HBeAg]]) y por el aumento significativo de la carga viral detectar la aparición de mutantes resistentes a los medicamentos antivirales.
 
Los métodos más utilizados para lalas cargacargas viralvirales de VHB y VHC son aquellos que utilizan la amplificación del RNAARN ([[Reacción en cadena de la polimerasa|PCR]] competitiva; PCR en tiempo real) o la amplificación de señales ([[DNAADN]] ramificado, bDNA) pero presentan limitaciones importantes pues tienen diferentes rangos de detección y aún no poseen un denominador común de medición, por lo tanto no son equivalentes ni comparables. Por tal razón los números absolutos expresados en ellos son referenciales y la evaluación de una caída significativa de una carga viral debe ser evaluada siempre en función de la diferencia en logslogaritmos en base 10.<ref>[http://web.archive.org/web/http://www.socgastro.cl/imagenes/vol17_2/29-Mu%F1oz.pdf Muñoz G, Gabriela. Diagnóstico serológico y virológico de la hepatitis C y B: Aspectos prácticos. Gastr Latinoam. 2006; 17(2): 249-52.]</ref>
 
== Carga viral de citomegalovirus ==
La cuantificación viral del [[citomegalovirus]] ([[CMV]]) se recomienda para control y tratamiento de pacientes [[inmunodeficiencia|inmunodeficientes]], como quienes padecen el [[síndrome de inmunodeficiencia adquirida]] o quienes reciben medicamentos [[inmunosupresor]]es como parte de su tratamiento con [[trasplante (medicina)]]s y en los cuales el citomegalovirus puede producir serias complicaciones, como una afección [[oportunista]], que ocasiona mayores tasas de [[morbilidad]] y [[mortalidad]]. La carga viral se requiere para monitorización de la [[medicina preventiva|profilaxis]] y del tratamiento preventivo o curativo con medicamentos [[antivirales]] que se recomienda en los casos de trasplante, dado que el CMV es el [[agente patógeno]] más importante que afecta los casos de [[trasplante]] por su correlación directa con el rechazo del [[injerto]] u [[trasplante|órgano trasplantado]]. Se recomienda su realización semanal, al menos mientras el paciente permanezca ingresado.<ref>Rosario, Vicente y Montero, Rafael. ''Tratado de trasplantes de órganos''. Volumen 2. Arán Ediciones, 2006. ISBN 84-95913-77-1, 9788495913777</ref><ref>Llamas Fuentes,Francisco et al. Citomegalovirus en el trasplante renal. ''Archivos de Medicina'', 2006; ''2''(6). [https://web.archive.org/web/20110828051937/http://archivosdemedicina.com/ojs/index.php/archmed/article/viewFile/0020601/68]</ref>
 
Igualmente la carga viral existente en [[líquido amniótico]] es un factor predictivo de la transmisión intrauterina, y los niños con infección congénita sintomática excretan más virus en la orina que los que tienen una infección asintomática, aunque todavía no se ha podido relacionar la carga viralvírica con el pronóstico en niños infectados de las complicaciones y secuelas de la infección por CMV como la [[hipoacusia]] neurosensorial.<ref>Foulon et al. Hearing Loss in Children With Congenital Cytomegalovirus Infection in Relation to... ''Pediatrics'', 2008; 122:1123-1127. [http://pediatrics.aappublications.org/cgi/content/full/122/6/e1123]</ref>
 
Las técnicas usadas para determinar la carga viral de CMV son las técnicas de la PCR cuantitativa o [[PCR en tiempo real]] y las de [[inmunoensayo]].
 
== Cuantificación de carga viral ==
Existen diferentes técnicas para poder cuantificar la carga viralvírica. Entre todas ellas podemos destacar las siguientes: [[Reacción en cadena de la polimerasa|PCR]], NASBA, Amplificación Qβ y Amplificación en rama.
 
Todos estos sistemas (a excepción de la Amplificaciónamplificación Qβ) se encuentran actualmente en el mercado. Aunque presentan una buena [[correlación]] entre sí, es recomendable utilizar el mismo método para determinar la carga viral a lo largo de la terapia de un paciente, pues puede haber variaciones en los resultados.
 
Además, es muy importante tener en cuenta la existencia de diferentes cepas de un mismo microorganismo. Esto implica que un sistema puede ser más [[sensible]] a una cepa que otro y, por tanto, más recomendable.
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:1º paso: el oligo b- (constituido por el cebador y el promotor de T7) se una a su secuencia complementaria específica presente en el extremo del ARN (o ADN) del virus que deseamos estudiar y detectar. (Suponemos obviamente que el virus está presente en la muestra, ya que en caso contrario no se produciría el proceso NASBA de amplificación).
:2º paso: la enzima retrotranscriptasa sintetiza un ADN complementario a la secuencia inicial de ARN diana mediante la elongación del cebador b-.
:3º paso: la enzima RNAasaARNasa degrada la hebra de ARN del heterodúplex ADN/ARN, quedando libre y expuesta la hebra de ADN complementaria.
:4º paso: el oligo a+ se une a la hebra de ADN mediante hibridación.
:5º paso: la enzima retrotranscriptasa elonga el oligo, creando otra cadena de ADN. Por tanto tenemos un ADN de doble cadena unido a un promotor T7P en uno de sus extremos.
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'''Electroquimioluminiscencia (ECL)''': se emplea el producto final del proceso NASBA para cuantificar. Para ello junto a la muestra de partida sobre la que realizamos NASBA, se añaden tres calibradores internos cuya secuencia es idéntica a la diana objeto de nuestro estudio salvo en 20 pares de bases que serán específicos de cada uno de ellos. Estos calibradores se encontrarán a unas concentraciones conocidas previamente: baja, media y alta respectivamente. Tras los sucesivos pasos de amplificación, y una vez terminado el proceso, la máquina que ha realizado el NASBA automáticamente dividirá la muestra en cuatro fracciones: diana, calibrador a baja concentración, calibrador a concentración media y calibrador a elevada concentración. Cada una de estas fracciones amplificadas hibridará con una sonda complementaria a los 20 pares de bases diferentes de cada amplicón. Dichas sondas contienen adheridas esferas magnéticos con estreptavidina. Las esferas se encuentran unidas a un electrodo, y a esta mezcla se añade otras sondas inespecíficas con ruterio, que también hibridarán con la secuencia amplificada. Una descarga eléctrica disparará la reacción de electroquimioluminiscencia, desprendiéndose una luz proporcional al número de copias iniciales de la secuencia diana. Comparando el resultado de la secuencia diana con los tres controles cuya concentración nos era conocida seremos capaces de obtener la carga viral inicial.
 
'''[[Balizas moleculares]] u oligobalizas''': este método permitirá cuantificar a tiempo real. A la mezcla inicial de reacción se han de añadir unas sondas específicas denominadas balizas moleculares (''Molecular beacon'' en inglés). Se tratan de unas secuencias con extremos complementarios entre sí de unos 5 pares de bases, pero que no son complementarios a la secuencia diana. Unido a uno de los extremos presentan un fluorocromo, mientras que en el extremo opuesto hay una molécula que inhibe al fluorocromo cuando está próximo a ésteeste.La zona situada entre estos dos extremos será la complementaria a la diana. Las oligobalizas cumplen estas mismas características, pero además funcionan como oligos para la amplificación.
 
Por tanto, cuando no exista secuencia diana con la que puedan hibridar, los extremos complementarios hibridarán entre sí y el fluorocromo estará inactivo. Pero cada vez que NASBA pase por el paso 6º o 12º las balizas moleculares se unirán a las secuencias complementarias del ARN diana amplificadas, separándose sus extremos y quedando liberado el fluorocromo, que emitirá una fluorescencia proporcional al número de hebras de ARN. Esto posibilita la cuantificando de la carga viral en cada uno de los ciclos.
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Se emplean dos tipos de [[sonda molecular|sonda]]:
* '''Sonda señalizadora''': se diseña partiendo de la estructura de ARN metaestable que reconoce la enzima Qβ replicasa. En esta estructura de ARN se clona una secuencia complementaria a la diana buscada (se unirá una sonda señalizadora por molécula de genoma viralvírico).
* '''Sonda de captura''': se diseña una secuencia complementaria a la diana, con un extremo poliG.
 
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=== Otros métodos ===
Además de las técnicas ya citadas, exitenexisten otros métodos utilizados para la cuantificación viral, tales como:
* ''Ensayos de captura de híbridos.
 
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:Para esta técnica, el ADN diana que pueda contener la muestra a analizar es purificado y se une con una sonda de ARN de cadena sencilla (sería necesario desnaturalizar previamente el ADN diana). El híbrido ADN-ARN forma una estructura característica que es reconocida por anticuerpos específicos (dobles cadenas de ADN o cadenas sencillas de ARN no son reconocidas). Estos anticuerpos están fijados a pocillos de placas [[Placa microtituladora|microtituladoras]], de manera que capturan el híbrido ADN-ARN (lo cual también facilita los procesos de lavado durante el ensayo). Los híbridos capturados se detectan añadiendo anticuerpos anti-híbrido ADN-ARN conjugados con [[fosfatasa alcalina]]. Se añade sustrato para la fosfatasa alcalina y se mide la [[quimioluminiscencia]].
 
:El ensayo de captura de híbridos es por tanto un método de amplificación de señal, ya que no se amplifica la cantidad de ADN diana, sino que ésteeste es aislado, unido a una sonda y finalmente a la señal específica para este híbrido diana-sonda.
 
* ''Amplificación basada en digestión.
 
:Esta técnica permite detectar el ácido nucleico de interés mediante el uso de varias sondas que se unen de forma superpuesta a la diana. Es importante el papel de la enzima bacteriana Cleavase, que reconoce secuencias de DNAADN supespuestassuperpuestas y realiza un corte en la estructura solapante que forman (esta actividad enzimática ''in vivo'' está relacionada con procesos de reparación de ADN).
 
:Para iniciar la amplificación, el ácido nucleico diana se mezcla con '''sonda señalizadora''' y '''sonda invasora'''. Ambas sondas se unen a la diana, con la peculiaridad de que el extremo 5' de la sonda señalizadora se superpone con la sonda invasora. La enzima Cleavase reconoce esta superposición y corta (digiere) la sonda señalizadora, que puede entonces actuar como una sonda invasora en el siguiente paso de la reacción.
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* ''Reacción en cadena de la ligasa'' (''LCR'', en inglés ''Ligase Chain Reaction'').
 
:La técnica de LCR se basa en la amplificación de sondas-cebadores (en inglés ''primers'')[[cebador]]es diseñados sintéticamente para que sean complementarios al ácido nucleico diana. Es necesario conocer previamente la secuencia diana al completo para poder elaborar estos oligonucleótidos. En técnicas de [[Reacción en cadena de la polimerasa|PCR]], puede existir una distancia de cientos de pares de bases entre los cebadores, que formará parte de la secuencia amplificada en la reacción. En LCR, los cebadores hibridan de forma contigua, separados únicamente por una base. En lugar de utilizar una [[ADN polimerasa]] para sintetizar la secuencias complementarias por extensión de los cebadores (como ocurre en PCR), una [[ADN ligasa]] liga (une) entre sí los cebadores que anillan adyancentes. Una falta de complementariedad con los oligos en la región diana (incluso de una sola base) impide la ligación de los cebadores. Estos cebadores ligados pueden servir como molde para que otros cebadores anillen sobre ellos.
 
:En LCR es necesario utilizar un [[termociclador]] para controlar la temperatura de los diferentes pasos:
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:La técnica de SDA consiste en una amplificación que transcurre isotérmicamente, es decir, tras la desnaturalización inicial, la reacción tiene lugar a una misma temperatura. Comprende dos fases:
 
::- Primera fase ('''generación de la diana'''): el ácido nucleico de la muestra es desnaturalizado por calor (95 °C). En cada extremo de la secuencia diana, un cebador y una sonda hibridan muy cerca el uno del otro. Las sondas contienen un sitio para [[enzima de restricción]]. La extensión del cebador es realizada por una DNAADN polimerasa deficiente en actividad exonucleasa derivada de ''E.coli'', que va incorporando además nucleótidos modificados dATPaS (5'-O-1-trifosfato 2'-deoxiadenosina). A medida que se extienden los cebadores, se desplazan las sondas, que también están siendo polimerizadas. Una segunda ronda de cebadores complementarios hibridan con las sondas desplazadas, de forma que la ADN polimerasa extiende estos segundos cebadores, generando una sondas de doble cadena. Estas sondas serán el ADN diana en la siguiente fase.
 
::- Segunda fase ('''amplificación exponencial de las sondas-diana'''): Cuando se añade la enzima de restricción a la reacción (que contiene ahora sondas de DNAADN de doble cadena), sólo una de las cadenas de la sonda será digerida (cortada) debido a que el sitio que debería existir en la región complementaria ha desaparecido por la introducción de nucleótidos dATPaS durante la polimerización. Esto genera una mella (en inglés ''nick'') en el ADN, desde la cual polimeriza la ADN polimerasa, lo que simultáneamente desplaza la cadena restante. Esta cadena se copia con cebadores que permitirán recuperar el sitio de restricción. En esta segunda reacción de polimerización también se utilizan nucleótidos dATPaS, por lo que una cadena de cada nuevo producto sintetizado será resistente al corte de la enzima, y la generación y extensión de la mella se puede repetir sin necesidad de volver a desnaturalizar. Este proceso repetitivo tiene lugar a unos 52 °C sin necesidad de [[termociclador]].
 
:El producto de esta amplificación son millones de copias de la sonda original. La adición de sonda fluorescente produce una señal que se corresponde con la cantidad de diana amplificada.
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* ''Sondas [[FRET]].
* ''Círculo rodante.
 
== Véase también ==
* [[Indetectable = Intransmisible]]
 
== Referencias ==