« Modélisation moléculaire » : différence entre les versions
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* boules et bâtons (''ball and stick''): les atomes sont représentés par les noyaux avec une boule et les liaisons par une tige |
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* modèle compact ([[:en:Space-filling model|''space filling'']]) : chaque atome est représenté par une sphère dont le rayon est, normalement, proportionnel au [[rayon de Van der Waals |
* modèle compact ([[:en:Space-filling model|''space filling'']]) : chaque atome est représenté par une sphère dont le rayon est, normalement, proportionnel au [[rayon de Van der Waals]]<br> de l'atome. |
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== Voir aussi == |
== Voir aussi == |
Version du 15 mai 2016 à 20:42
La modélisation moléculaire est un ensemble de techniques pour modéliser ou imiter le comportement de molécules.
Couleur des atomes
Modélisation moléculaire de certains atomes:
- Oxygène (O) : rouge
- Carbone (C) : noir
- Hydrogène (H) : blanc
- Chlore (Cl) : vert
- Soufre (S) : jaune
- Azote (N) : bleu
- Fer (Fe) : gris
Représentations
Il existe différents types de représentations :
- fils de fer (wire): on ne représente que les liaisons entre les atomes par un trait
- bâtons (stick) : on ne représente que les liaisons par une tige
- boules et bâtons (ball and stick): les atomes sont représentés par les noyaux avec une boule et les liaisons par une tige
- modèle compact (space filling) : chaque atome est représenté par une sphère dont le rayon est, normalement, proportionnel au rayon de Van der Waals
de l'atome.
Voir aussi
- Biologie structurale
- Chimie numérique
- Dynamique moléculaire
- Mécanique moléculaire
- Méthode de Monte-Carlo
- Structure des protéines
- Chimie quantique
Références
- A.R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications, 2001, ISBN 0-582-38210-6
- Daan Frenkel, Berend Smit Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 1996, ISBN 0-12-267370-0