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SARSコロナウイルス2-ゼータ株

SARSコロナウイルス2の変異株

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新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) > SARS-CoV-2の変異株 > ゼータ株 (系統 P.2)

SARSコロナウイルス2-ゼータ株（サーズコロナウイルスツー ゼータかぶ、英語: SARS-CoV-2 Zeta variant、別名: 系統 P.2、系統 B.1.1.28.2、20B/S.484K）は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の原因ウイルスとして知られるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異株である。ブラジルのリオデジャネイロ州で最初に検出された。世界保健機関（WHO）のラベルでは、ゼータ株（Zeta variant）に分類されている[1]。

E484K変異は含まれているが、N501Y及びK417T変異は含まれていない。マナウスのガンマ株（系統 P.1）に直接関係することはなく、リオデジャネイロで独立して進化した[2][3]。

WHOによって提案された簡略化された命名案の下で、系統 P.2は「ゼータ変異株」とラベル付けされ、注目すべき変異株（VOI）と見なされたが、懸念される変異株（VOC）には分類されなかった[4]。ゼータ株は2021年7月、WHOによるVOIから除外された[1][5]。

分類

命名

2020年4月、この系統がブラジルのリオデジャネイロ州で初めて記録され、後に系統 P.2（lineage P.2）と命名された[1][6]。2021年5月末、WHOは懸念される変異株（VOC）や注目すべき変異株（VOI）にギリシャ文字を使用する新しい方針を導入した後、系統 P.2に対しゼータ（ζ:Zeta）のラベルを割り当てた[1][6]。

変異

「SARSコロナウイルス2の変異株#ミスセンス変異」も参照

ゼータ株のゲノムには、E484K・D614G・V1176Fの3つのアミノ酸変異があり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれている[7]。アメリカ疾病予防管理センター（CDC）によると、F565Lはすべてではないが、一部のゼータ変異株配列で検出されている[8]。

  •  
    スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異[7]。

脚注

[脚注の使い方]
  1. ^ a b c d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2021年10月1日閲覧。
  2. ^ “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 28 January 2021閲覧。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”
  3. ^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8139668/. 
  4. ^ “Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings” (英語). Virological (2021年1月12日). 2021年6月26日閲覧。
  5. ^ 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について （第11報） - 国立感染症研究所 (2021年7⽉17⽇) 、2021年8月15日閲覧。
  6. ^ a b “新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告”. 厚生労働省. (2021年6月8日). https://www.forth.go.jp/topics/20210611.html 2021年10月2日閲覧。 
  7. ^ a b “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (1 July 2021). 2021年7月5日閲覧。
  8. ^ “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 5 July 2021閲覧。

関連項目

外部リンク

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