SARSコロナウイルス2-ゼータ株
SARSコロナウイルス2-ゼータ株(サーズコロナウイルスツー ゼータかぶ、英語: SARS-CoV-2 Zeta variant、別名: 系統 P.2、系統 B.1.1.28.2、20B/S.484K)は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の原因ウイルスとして知られるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異株である。ブラジルのリオデジャネイロ州で最初に検出された。世界保健機関(WHO)のラベルでは、ゼータ株(Zeta variant)に分類されている[1]。
E484K変異は含まれているが、N501Y及びK417T変異は含まれていない。マナウスのガンマ株(系統 P.1)に直接関係することはなく、リオデジャネイロで独立して進化した[2][3]。
WHOによって提案された簡略化された命名案の下で、系統 P.2は「ゼータ変異株」とラベル付けされ、注目すべき変異株(VOI)と見なされたが、懸念される変異株(VOC)には分類されなかった[4]。ゼータ株は2021年7月、WHOによるVOIから除外された[1][5]。
分類
命名
2020年4月、この系統がブラジルのリオデジャネイロ州で初めて記録され、後に系統 P.2(lineage P.2)と命名された[1][6]。2021年5月末、WHOは懸念される変異株(VOC)や注目すべき変異株(VOI)にギリシャ文字を使用する新しい方針を導入した後、系統 P.2に対しゼータ(ζ:Zeta)のラベルを割り当てた[1][6]。
変異
ゼータ株のゲノムには、E484K・D614G・V1176Fの3つのアミノ酸変異があり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれている[7]。アメリカ疾病予防管理センター(CDC)によると、F565Lはすべてではないが、一部のゼータ変異株配列で検出されている[8]。
-
スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異[7]。
脚注
- ^ a b c d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2021年10月1日閲覧。
- ^ “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 28 January 2021閲覧。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”
- ^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194 .
- ^ “Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings” (英語). Virological (2021年1月12日). 2021年6月26日閲覧。
- ^ 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)の新規変異株について (第11報) - 国立感染症研究所 (2021年7⽉17⽇) 、2021年8月15日閲覧。
- ^ a b “新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告”. 厚生労働省. (2021年6月8日) 2021年10月2日閲覧。
- ^ a b “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (1 July 2021). 2021年7月5日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 5 July 2021閲覧。
関連項目
- 懸念される変異株
- ガンマ株 (系統 P.1) - 同じく最初にブラジルで流行した株。
- シータ株 (系統 P.3)
- アルファ株 (系統 B.1.1.7)
- ベータ株 (系統 B.1.351)
- イプシロン株 (系統 B.1.427/B.1.429)
- イータ株 (系統 B.1.525)
- イオタ株 (系統 B.1.526)
- 系統 B.1.617
- ミュー株 (系統 B.1.621) - 最初にコロンビアで確認された株。
- ラムダ株 (系統 C.37) - 最初にペルーで確認され、特に南米で流行している株。
- 南北アメリカにおける2019年コロナウイルス感染症の流行状況
外部リンク
- Tracking SARS-CoV-2 variants - 世界保健機関 (WHO)
- Variants and Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 - アメリカ疾病予防管理センター (CDC)
- Lineage P.2 - PANGO lineages
- 新型コロナウイルス感染症について - 厚生労働省
- 新型コロナウイルス感染症に関する報道発表資料 変異株 - 厚生労働省
- 新型コロナウイルス感染症(COVID-19)関連情報 - 国立感染症研究所