В мае 2021 года СМИ сообщили о том, что ГУП «Московский метрополитен» увольняет сотрудников из-за того, что они зарегистрировались [[Протесты в поддержку Алексея Навального (2021)|на сайте в поддержку Навального]]. На 15 мая было уволено не менее 40 человек. Работникам предлагают уволиться по соглашению сторон, а в случае отказа увольняют по статье за прогул. Депутат Мосгордумы от «Справедливой России» [[Тимонов, Михаил Леонидович|Михаил Тимонов]] назвал массовое увольнение антиконституционным деянием, которое «входит в противоречие в том числе с уголовным кодексом РФ, не допускающим дискриминацию». Независимый профсоюз ГУП «Московский метрополитен» сообщил, что намерен помогать уволенным сотрудникам<ref>{{Cite web|lang=ru|url=https://www.rfi.fr/ru/%D1%80%D0%BE%D1%81%D1%81%D0%B8%D1%8F/20210515-%D1%83%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D1%8B-%D0%BD%D0%B5-%D0%BF%D0%BE-%D1%81%D0%BE%D0%B1%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D1%83-%D0%B6%D0%B5%D0%BB%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%8E-%D0%BA%D0%B0%D0%BA-%D0%BB%D0%B8%D1%88%D0%B0%D1%8E%D1%82-%D1%80%D0%B0%D0%B1%D0%BE%D1%82%D1%8B-%D1%82%D0%B5%D1%85-%D0%BA%D1%82%D0%BE-%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B6%D0%B8%D0%B2%D0%B0%D0%B5%D1%82-%D0%BE%D0%BF%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%B8%D1%86%D0%B8%D1%8E-%D0%B2-%D1%80%D0%BE%D1%81%D1%81%D0%B8%D0%B8|title=Уволены не по собственному желанию. Как лишают работы тех, кто поддерживает оппозицию в России|author=https://www.facebook.com/rfi.russian|website=RFI|date=2021-05-15|access-date=2023-06-04|archive-date=2021-05-15|archive-url=https://web.archive.org/web/20210515203318/https://www.rfi.fr/ru/%D1%80%D0%BE%D1%81%D1%81%D0%B8%D1%8F/20210515-%D1%83%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D1%8B-%D0%BD%D0%B5-%D0%BF%D0%BE-%D1%81%D0%BE%D0%B1%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D1%83-%D0%B6%D0%B5%D0%BB%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%8E-%D0%BA%D0%B0%D0%BA-%D0%BB%D0%B8%D1%88%D0%B0%D1%8E%D1%82-%D1%80%D0%B0%D0%B1%D0%BE%D1%82%D1%8B-%D1%82%D0%B5%D1%85-%D0%BA%D1%82%D0%BE-%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B6%D0%B8%D0%B2%D0%B0%D0%B5%D1%82-%D0%BE%D0%BF%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%B8%D1%86%D0%B8%D1%8E-%D0%B2-%D1%80%D0%BE%D1%81%D1%81%D0%B8%D0%B8|deadlink=no}}</ref>. Итогом стало восстановление 37 сотрудников с компенсациями простоя и морального вреда<ref>{{Cite web|lang=ru|url=https://www.rbc.ru/politics/03/06/2023/647a9b1b9a7947687795f2f2|title=Суд вернул на работу 37 уволенных сотрудников московского метро|website=РБК|date=2023-06-03|access-date=2023-06-04|archive-date=2023-06-03|archive-url=https://web.archive.org/web/20230603142221/https://www.rbc.ru/politics/03/06/2023/647a9b1b9a7947687795f2f2|deadlink=no}}</ref><ref>{{Cite web|lang=ru-RU|url=https://holod.media/2023/06/04/uvolennye-za-podderzhku-navalnogo-sotrudniki-moskovskogo-metro-cherez-sud-dobilis-vosstanovleniya-v-dolzhnostyah/|title=Уволенные за поддержку Навального сотрудники московского метро через суд добились восстановления в должностях|website=Журнал «Холод»|date=2023-06-04|access-date=2023-06-04|archive-date=2023-06-04|archive-url=https://web.archive.org/web/20230604111034/https://holod.media/2023/06/04/uvolennye-za-podderzhku-navalnogo-sotrudniki-moskovskogo-metro-cherez-sud-dobilis-vosstanovleniya-v-dolzhnostyah/|deadlink=no}}</ref>.
В октябре 2022 года стало известно о массовых жалобах машинистов поездов на [[Мобилизация в России (2022)|мобилизацию]], связанную со [[Вторжение России на Украину (2022)|вторжением России на Украину]]<ref name=Gotowar>{{Cite web|lang=ru|url=https://rtvi.com/news/mashinisty-moskovskogo-metro-stali-massovo-zhalovatsya-na-mobilizacziyu-do-etogo-im-obeshhali-bron-kak-rabotnikam-strategicheskogo-obekta/|title=Машинисты московского метро стали массово жаловаться на мобилизацию. До этого им обещали бронь как работникам стратегического объекта|author=Дмитрий Никитин|website=RTVI|date=2022-10-01|access-date=2022-10-02|archive-date=2022-10-01|archive-url=https://web.archive.org/web/20221001080736/https://rtvi.com/news/mashinisty-moskovskogo-metro-stali-massovo-zhalovatsya-na-mobilizacziyu-do-etogo-im-obeshhali-bron-kak-rabotnikam-strategicheskogo-obekta/|deadlink=no}}</ref>.
