ATG16L1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
ATG16L1 (англ. Autophagy related 16 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 68 265[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSGLRAADF | PRWKRHISEQ | LRRRDRLQRQ | AFEEIILQYN | KLLEKSDLHS | ||||
VLAQKLQAEK | HDVPNRHEIS | PGHDGTWNDN | QLQEMAQLRI | KHQEELTELH | ||||
KKRGELAQLV | IDLNNQMQRK | DREMQMNEAK | IAECLQTISD | LETECLDLRT | ||||
KLCDLERANQ | TLKDEYDALQ | ITFTALEGKL | RKTTEENQEL | VTRWMAEKAQ | ||||
EANRLNAENE | KDSRRRQARL | QKELAEAAKE | PLPVEQDDDI | EVIVDETSDH | ||||
TEETSPVRAI | SRAATKRLSQ | PAGGLLDSIT | NIFGRRSVSS | FPVPQDNVDT | ||||
HPGSGKEVRV | PATALCVFDA | HDGEVNAVQF | SPGSRLLATG | GMDRRVKLWE | ||||
VFGEKCEFKG | SLSGSNAGIT | SIEFDSAGSY | LLAASNDFAS | RIWTVDDYRL | ||||
RHTLTGHSGK | VLSAKFLLDN | ARIVSGSHDR | TLKLWDLRSK | VCIKTVFAGS | ||||
SCNDIVCTEQ | CVMSGHFDKK | IRFWDIRSES | IVREMELLGK | ITALDLNPER | ||||
TELLSCSRDD | LLKVIDLRTN | AIKQTFSAPG | FKCGSDWTRV | VFSPDGSYVA | ||||
AGSAEGSLYI | WSVLTGKVEK | VLSKQHSSSI | NAVAWSPSGS | HVVSVDKGCK | ||||
AVLWAQY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ravikumar B., Moreau K., Jahreiss L., Puri C., Rubinsztein D.C. (2010). Plasma membrane contributes to the formation of pre-autophagosomal structures. Nat. Cell Biol. 12: 747—757. PMID 20639872 DOI:10.1038/ncb2078
- Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115
- Gammoh N., Florey O., Overholtzer M., Jiang X. (2013). Interaction between FIP200 and ATG16L1 distinguishes ULK1 complex-dependent and -independent autophagy. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 144—149. PMID 23262492 DOI:10.1038/nsmb.2475
- Otomo C., Metlagel Z., Takaesu G., Otomo T. (2013). Structure of the human ATG12-ATG5 conjugate required for LC3 lipidation in autophagy. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 59—66. PMID 23202584 DOI:10.1038/nsmb.2431
- Metlagel Z., Otomo C., Takaesu G., Otomo T. (2013). Structural basis of ATG3 recognition by the autophagic ubiquitin-like protein ATG12. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 18844—18849. PMID 24191030 DOI:10.1073/pnas.1314755110
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ATG16L1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21498 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q676U5 (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |