BDNF: відмінності між версіями

BDNF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BND, 1B8M
Ідентифікатори
Символи	BDNF, brain-derived neurotrophic factor, ANON2, BULN2, Brain-derived neurotrophic factor, brain derived neurotrophic factor
Зовнішні ІД	OMIM: 113505 MGI: 88145 HomoloGene: 7245 GeneCards: BDNF
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • neurotrophin TRKB receptor binding; • growth factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • мітохондрія; • nuclear speck; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular region; • міжклітинний простір; • Синаптичні бульбашки; • аксон; • дендрит (нейробіологія);
Біологічний процес	• brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • synapse assembly; • cell-cell signaling; • positive regulation of brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • collateral sprouting; • positive regulation of synapse assembly; • positive regulation of collateral sprouting; • нейробіологія розвитку; • axon guidance; • negative regulation of myotube differentiation; • positive regulation of receptor binding; • regulation of protein localization to cell surface; • regulation of signaling receptor activity; • activation of phospholipase C activity; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • peripheral nervous system development; • пам'ять; • nerve development; • nerve growth factor signaling pathway; • regulation of neuron differentiation; • neuron projection morphogenesis; • modulation of chemical synaptic transmission; • positive regulation of neuron projection development; • negative regulation of apoptotic signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	627
	12064
	ENSG00000176697
	ENSMUSG00000048482
	P23560
	P21237
NM_001143805; NM_001143806; NM_001143807; NM_001143808; NM_001143809;
	NM_001143810; NM_001143811; NM_001143812; NM_001143813; NM_001143814; NM_001143815; NM_001143816; NM_001709; NM_170731; NM_170732; NM_170733; NM_170734; NM_170735
NM_001048139; NM_001048141; NM_001048142; NM_007540; NM_001285416;
	NM_001285417; NM_001285418; NM_001285419; NM_001285420; NM_001285421; NM_001285422; NM_001316310
NP_001137277; NP_001137278; NP_001137279; NP_001137280; NP_001137281;
	NP_001137282; NP_001137283; NP_001137284; NP_001137285; NP_001137286; NP_001137288; NP_001700; NP_733927; NP_733928; NP_733929; NP_733930; NP_733931
NP_001041604; NP_001041606; NP_001041607; NP_001272345; NP_001272346;
	NP_001272347; NP_001272348; NP_001272349; NP_001272350; NP_001272351; NP_001303239; NP_031566
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Інтерактивний перегляд історії

[перевірена версія]

← Попереднє редагування

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Поточна версія на 14:19, 20 жовтня 2022

BDNF (англ. Brain derived neurotrophic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 27 818^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTILFLTMVI	SYFGCMKAAP	MKEANIRGQG	GLAYPGVRTH	GTLESVNGPK
AGSRGLTSLA	DTFEHVIEEL	LDEDQKVRPN	EENNKDADLY	TSRVMLSSQV
PLEPPLLFLL	EEYKNYLDAA	NMSMRVRRHS	DPARRGELSV	CDSISEWVTA
ADKKTAVDMS	GGTVTVLEKV	PVSKGQLKQY	FYETKCNPMG	YTKEGCRGID
KRHWNSQCRT	TQSYVRALTM	DSKKRIGWRF	IRIDTSCVCT	LTIKRGR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Jones K.R., Reichardt L.F. (1990). Molecular cloning of a human gene that is a member of the nerve growth factor family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8060—8064. PMID 2236018 DOI:10.1073/pnas.87.20.8060
Shintani A., Ono Y., Kaisho Y., Igarashi K. (1992). Characterization of the 5'-flanking region of the human brain-derived neurotrophic factor gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 325—332. PMID 1339267 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80148-2
Pruunsild P., Kazantseva A., Aid T., Palm K., Timmusk T. (2007). Dissecting the human BDNF locus: bidirectional transcription, complex splicing, and multiple promoters. Genomics. 90: 397—406. PMID 17629449 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.05.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hallboeoek F., Ibanez C.F., Persson H. (1991). Evolutionary studies of the nerve growth factor family reveal a novel member abundantly expressed in Xenopus ovary. Neuron. 6: 845—858. PMID 2025430 DOI:10.1016/0896-6273(91)90180-8
Robinson R.C., Radziejewski C., Stuart D.I., Jones E.Y. (1995). Structure of the brain-derived neurotrophic factor/neurotrophin 3 heterodimer. Biochemistry. 34: 4139—4146. PMID 7703225 DOI:10.1021/bi00013a001

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з BDNF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1033 (англ.) . Архів оригіналу за 13 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P23560 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з BDNF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1033 (англ.) . Архів оригіналу за 13 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P23560 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

@@ Рядок 1: / Рядок 1: @@
 {{Картка гена}}
-'''BDNF''' ({{lang-en|Brain derived neurotrophic factor}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web|url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:1033 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1033 |language=англ. |accessdate=8 вересня 2017}}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 27 818<ref name="UniProt">{{cite web|url=http://www.uniprot.org/uniprot/P23560#sequences |title=UniProt, P23560 |language=англ. |accessdate=8 вересня 2017}}</ref>.
+'''BDNF''' ({{lang-en|Brain derived neurotrophic factor}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web |url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:1033 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1033 |language=англ. |accessdate=8 вересня 2017 |archive-date=13 липня 2017 |archive-url=https://web.archive.org/web/20170713022614/http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:1033 }}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 27 818<ref name="UniProt">{{cite web |url=http://www.uniprot.org/uniprot/P23560#sequences |title=UniProt, P23560 |language=англ. |accessdate=8 вересня 2017 |archive-date=5 вересня 2017 |archive-url=https://web.archive.org/web/20170905184639/http://www.uniprot.org/uniprot/P23560#sequences }}</ref>.
 {{hidden
@@ Рядок 9: / Рядок 9: @@
  |content=<table  style="font-family:monospace;">
 <tr style="text-align:right;"><th>10</th><th></th><th>20</th><th></th><th>30</th><th></th><th>40</th><th></th><th>50</th></tr>
-<tr style="background-color: #eee;"><td>[[Метіонін|M]][[Треонін|T]][[Ізолейцин|I]][[Лейцин|L]][[Фенілаланін|F]][[Лейцин|L]][[Треонін|T]][[Метіонін|M]][[Валін|V]][[Ізолейцин|I]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Серин|S]][[Тирозин|Y]][[Фенілаланін|F]][[Гліцин|G]][[Цистеїн|C]][[Метіонін|M]][[Лізин|K]][[Аланін|A]][[Аланін|A]][[Пролін|P]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Метіонін|M]][[Лізин|K]][[Глутамінова кислота|E]][[Аланін|A]][[Аспарагін|N]][[Ізолейцин|I]][[Аргінін|R]][[Гліцин|G]][[Глутамін|Q]][[Гліцин|G]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Гліцин|G]][[Лейцин|L]][[Аланін|A]][[Тирозин|Y]][[Пролін|P]][[Гліцин|G]][[Валін|V]][[Аргінін|R]][[Треонін|T]][[Гістидин|H]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Гліцин|G]][[Треонін|T]][[Лейцин|L]][[Глутамінова кислота|E]][[Серин|S]][[Валін|V]][[Аспарагін|N]][[Гліцин|G]][[Пролін|P]][[Лізин|K]]</td></tr>
+<tr style="background-color: #eee;"><td>MTILFLTMVI</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SYFGCMKAAP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>MKEANIRGQG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GLAYPGVRTH</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GTLESVNGPK</td></tr>
+<tr style="background-color: #eee;"><td>AGSRGLTSLA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DTFEHVIEEL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LDEDQKVRPN</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>EENNKDADLY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>TSRVMLSSQV</td></tr>
-<tr style="background-color: #eee;"><td>[[Аланін|A]][[Гліцин|G]][[Серин|S]][[Аргінін|R]][[Гліцин|G]][[Лейцин|L]][[Треонін|T]][[Серин|S]][[Лейцин|L]][[Аланін|A]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Аспарагінова кислота|D]][[Треонін|T]][[Фенілаланін|F]][[Глутамінова кислота|E]][[Гістидин|H]][[Валін|V]][[Ізолейцин|I]][[Глутамінова кислота|E]][[Глутамінова кислота|E]][[Лейцин|L]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Лейцин|L]][[Аспарагінова кислота|D]][[Глутамінова кислота|E]][[Аспарагінова кислота|D]][[Глутамін|Q]][[Лізин|K]][[Валін|V]][[Аргінін|R]][[Пролін|P]][[Аспарагін|N]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Глутамінова кислота|E]][[Глутамінова кислота|E]][[Аспарагін|N]][[Аспарагін|N]][[Лізин|K]][[Аспарагінова кислота|D]][[Аланін|A]][[Аспарагінова кислота|D]][[Лейцин|L]][[Тирозин|Y]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Треонін|T]][[Серин|S]][[Аргінін|R]][[Валін|V]][[Метіонін|M]][[Лейцин|L]][[Серин|S]][[Серин|S]][[Глутамін|Q]][[Валін|V]]</td></tr>
+<tr style="background-color: #eee;"><td>PLEPPLLFLL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>EEYKNYLDAA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>NMSMRVRRHS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DPARRGELSV</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>CDSISEWVTA</td></tr>
-<tr style="background-color: #eee;"><td>[[Пролін|P]][[Лейцин|L]][[Глутамінова кислота|E]][[Пролін|P]][[Пролін|P]][[Лейцин|L]][[Лейцин|L]][[Фенілаланін|F]][[Лейцин|L]][[Лейцин|L]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Глутамінова кислота|E]][[Глутамінова кислота|E]][[Тирозин|Y]][[Лізин|K]][[Аспарагін|N]][[Тирозин|Y]][[Лейцин|L]][[Аспарагінова кислота|D]][[Аланін|A]][[Аланін|A]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Аспарагін|N]][[Метіонін|M]][[Серин|S]][[Метіонін|M]][[Аргінін|R]][[Валін|V]][[Аргінін|R]][[Аргінін|R]][[Гістидин|H]][[Серин|S]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Аспарагінова кислота|D]][[Пролін|P]][[Аланін|A]][[Аргінін|R]][[Аргінін|R]][[Гліцин|G]][[Глутамінова кислота|E]][[Лейцин|L]][[Серин|S]][[Валін|V]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Цистеїн|C]][[Аспарагінова кислота|D]][[Серин|S]][[Ізолейцин|I]][[Серин|S]][[Глутамінова кислота|E]][[Триптофан|W]][[Валін|V]][[Треонін|T]][[Аланін|A]]</td></tr>
+<tr style="background-color: #eee;"><td>ADKKTAVDMS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GGTVTVLEKV</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PVSKGQLKQY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>FYETKCNPMG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>YTKEGCRGID</td></tr>
-<tr style="background-color: #eee;"><td>[[Аланін|A]][[Аспарагінова кислота|D]][[Лізин|K]][[Лізин|K]][[Треонін|T]][[Аланін|A]][[Валін|V]][[Аспарагінова кислота|D]][[Метіонін|M]][[Серин|S]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Гліцин|G]][[Гліцин|G]][[Треонін|T]][[Валін|V]][[Треонін|T]][[Валін|V]][[Лейцин|L]][[Глутамінова кислота|E]][[Лізин|K]][[Валін|V]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Пролін|P]][[Валін|V]][[Серин|S]][[Лізин|K]][[Гліцин|G]][[Глутамін|Q]][[Лейцин|L]][[Лізин|K]][[Глутамін|Q]][[Тирозин|Y]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Фенілаланін|F]][[Тирозин|Y]][[Глутамінова кислота|E]][[Треонін|T]][[Лізин|K]][[Цистеїн|C]][[Аспарагін|N]][[Пролін|P]][[Метіонін|M]][[Гліцин|G]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Тирозин|Y]][[Треонін|T]][[Лізин|K]][[Глутамінова кислота|E]][[Гліцин|G]][[Цистеїн|C]][[Аргінін|R]][[Гліцин|G]][[Ізолейцин|I]][[Аспарагінова кислота|D]]</td></tr>
-<tr style="background-color: #eee;"><td>[[Лізин|K]][[Аргінін|R]][[Гістидин|H]][[Триптофан|W]][[Аспарагін|N]][[Серин|S]][[Глутамін|Q]][[Цистеїн|C]][[Аргінін|R]][[Треонін|T]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Треонін|T]][[Глутамін|Q]][[Серин|S]][[Тирозин|Y]][[Валін|V]][[Аргінін|R]][[Аланін|A]][[Лейцин|L]][[Треонін|T]][[Метіонін|M]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Аспарагінова кислота|D]][[Серин|S]][[Лізин|K]][[Лізин|K]][[Аргінін|R]][[Ізолейцин|I]][[Гліцин|G]][[Триптофан|W]][[Аргінін|R]][[Фенілаланін|F]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Ізолейцин|I]][[Аргінін|R]][[Ізолейцин|I]][[Аспарагінова кислота|D]][[Треонін|T]][[Серин|S]][[Цистеїн|C]][[Валін|V]][[Цистеїн|C]][[Треонін|T]]</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>[[Лейцин|L]][[Треонін|T]][[Ізолейцин|I]][[Лізин|K]][[Аргінін|R]][[Гліцин|G]][[Аргінін|R]]</td></tr>
+<tr style="background-color: #eee;"><td>KRHWNSQCRT</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>TQSYVRALTM</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DSKKRIGWRF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>IRIDTSCVCT</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LTIKRGR</td></tr>
 </table>
-}}
+<div style="font-family:monospace; width:30em; column-count: 3">
+A: [[Аланін]]<br />
+C: [[Цистеїн]]<br />
+D: [[Аспарагінова кислота]]<br />
+E: [[Глутамінова кислота]]<br />
+F: [[Фенілаланін]]<br />
+G: [[Гліцин]]<br />
+H: [[Гістидин]]<br />
+I: [[Ізолейцин]]<br />
+K: [[Лізин]]<br />
+L: [[Лейцин]]<br />
+M: [[Метіонін]]<br />
+N: [[Аспарагін]]<br />
+P: [[Пролін]]<br />
+Q: [[Глутамін]]<br />
+R: [[Аргінін]]<br />
+S: [[Серин]]<br />
+T: [[Треонін]]<br />
+V: [[Валін]]<br />
+W: [[Триптофан]]<br />
+Y: [[Тирозин]]</div>}}
 Кодований геном білок за функцією належить до [[фактори росту|факторів росту]].
@@ Рядок 36: / Рядок 57: @@
 * [[Хромосома 11 (людина)|Хромосома 11]]
 {{protein-stub}}
-[[Категорія:Фактори росту]]
-[[Категорія:Клітинна нейрофізіологія]]
+{{Портали|Біологія|Хімія}}[[Категорія:Фактори росту]]
+[[Категорія:Білки нервової системи]]

BDNF: відмінності між версіями

Поточна версія на 14:19, 20 жовтня 2022

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук