Projet:Biologie/Bases de données suivies

Dans le but de compléter la page d'aide Projet:Biologie/Comment trouver et traiter les noms français ou scientifiques, cette page se propose d'indiquer les bases de données suivies de préférence selon les espèces par les différents sous-projets liés au Projet:Biologie sur Wikipédia. On en profitera pour préciser les modèles de Catégorie:Modèle de biologie créant un lien externe utilisable pour référencer ces bases de données.

D'une part pour le choix du titre et des noms redirigés, d'autre part pour la rédaction de la taxobox et enfin pour le choix des classifications indiquées dans l'article.

Botanique

Algues

• AlgaeBase : {{AlgaeBASE espèce}}, {{AlgaeBASE genre}}, {{AlgaeBASE}}.
• WoRMS : plusieurs algues y sont, mais c'est habituellement une copie du site AlgaeBase (modèles {{WRMS}} et {{WRMS espèce}}).
• {{INAlgarum}} 

Champignons

• Index Fungorum : {{Fungorum espèce}}, {{Fungorum genre}}, {{Fungorum famille}}, {{Fungorum suprafamille}}.
• MycoBank : {{MycoBank}} (les identifiants de MycoBank et Fungorum sont les mêmes sur les deux bases de données)

À signaler : le modèle {{Mycodoc}} permet d'ajouter une référence vers la page de bibliographie d'une espèce de champignon sur le site de la Société mycologique de France (base de données Mycodoc).

Plantes

• Kew Garden World Checklist: {{Kew liste}}
• Kew Garden Vascular Plant Families and Genera: {{Kew vpfg}}
• Tropicos: {{Tropicos}}
• The Plant List: {{ThePlantList espèce}}
• [GRIN]

Zoologie

Vertébrés

Mammalogie

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Taxobox : facilement générée par le logiciel WikipediaBioReferences (WBR). Catalogue of Life, ITIS ou MSW servent à créer la liste par défaut, préciser par exemple classification=MSW dans {{Taxobox début}} pour une classification différente.
• Classifications dans l'article : liste générée par le logiciel WBR. En cas de divergence, priorité accordée à Mammal Species of the World (consultation de la base de données MSW).
• Modèle(s): {{MSW}}, {{ITIS}}, {{CatalogueofLife genre}}, {{CatalogueofLife espèce}}...

Ornithologie

Taxons modernes

• Titre : Nomenclature normalisée CINFO : une liste existe dans le projet (Projet:Ornithologie/Liste des noms normalisés-1)
• Taxobox : générée par le logiciel WikipediaBioReferences (WBR)
• Classifications : Congrès ornithologique international (pour taxobox et catégories)
• Modèle(s): {{COI}} et {{Avibase2}}

Reptiles

Taxons actuels sauf tortues

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : The Reptile Database
• Modèle(s): {{ReptileDB espèce}}, {{ReptileDB genre}} et {{ReptileDB famille}}

Tortues

Taxons actuels

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : Tortoise and Freshwater Turtle Specialist Group
• Modèle(s): {{TFTSG}}

Amphibiens

Taxons actuels

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : Amphibian Species of the World
• Modèle(s): {{ASW espèce}}, {{ASW genre}}, {{ASW sous-famille}}, {{ASW famille}} et {{ASW}}

Poissons

Taxons actuels

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : FishBase ou Catalog of Fishes ?
• Modèle(s): {{FishBase espèce}}, {{FishBase genre}}, {{FishBase famille}} et {{FishBase ordre}}

Arthropodes

Araignées

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : World Spider Catalog
• Modèles : {{WSC famille}}, {{WSC non-famille}}

Pseudoscorpions

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : Pseudoscorpions of the world

Scorpions

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : Scorpion Files

Mollusques

• Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
• Classification : World Register of Marine Species, prenant pour base Bouchet & Rocroi, mais actualisé avec les taxons nouvellement décrits, notamment. Peuvent également être utiles en:Taxonomy of the Gastropoda (Bouchet & Rocroi, 2005) ou en:Changes in the taxonomy of gastropods since 2005
• Modèles : {{SeaLifeBase espèce}}, {{WRMS espèce}} et {{SeaSlugForum}}

Échinodermes

• Titre : en français si nom unique pour le taxon (rare), sinon nom scientifique et redirections des noms français, avec éventuellement articles d'homonymie.
• Classification : World Register of Marine Species, prenant pour base Kroh & Smith, mais actualisé avec les taxons nouvellement décrits, notamment.
• Modèles : {{SeaLifeBase espèce}}, {{WRMS espèce}} et {{TPDB}} (pour les nombreux clades fossiles, pas toujours recensés par WoRMS).

A signaler : les pages les plus anciennes fondent encore la phylogénie sur {{ITIS}}, mais celle-ci est obsolète de l'avis des spécialistes. Cela explique les incohérences parfois encore rencontrées entre deux pages. Dans un souci de compromis, il est possible de faire figurer dans l'article les deux phylogénies côte à côte en en précisant l'origine (comme sur l'article Oursin), et d'utiliser WoRMS dans la taxobox.

Voir aussi

Les titres en biologie

• Projet:Biologie/Comment trouver et traiter les noms français ou scientifiques
• Conventions sur les titres de biologie

Aide en biologie

• Projet:Biologie/Aide au contributeur avec toutes les pages d'aide en biologie : comment contribuer, choix des titres, choix des noms scientifiques et français, choix des box et plusieurs articles-guides rédactionnels, de l'ébauche à l'article complet.