HMGB1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
HMGB1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HMGB1, HMG1, HMG3, SBP-1, HMG-1, high mobility group box 1, HMGB-1
Зовнішні ІД OMIM: 163905 HomoloGene: 110676 GeneCards: HMGB1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001313892
NM_001313893
NM_002128
NM_199555
RefSeq (білок)
NP_955849
Локус (UCSC) Хр. 13: 30.46 – 30.62 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HMGB1 (англ. High mobility group box 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 24 894[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWK
TMSAKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPS
AFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAK
LKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEE
EDEEDEDEEEDDDDE

Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, пошкодження ДНК, репарація ДНК, хемотаксис, рекомбінація ДНК, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, хромосомах, ендосомах. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Wen L., Huang J.K., Johnson B.H., Reeck G.R. (1989). A human placental cDNA clone that encodes nonhistone chromosomal protein HMG-1. Nucleic Acids Res. 17: 1197—1214. PMID 2922262 DOI:10.1093/nar/17.3.1197
  • Ferrari S., Finelli P., Rocchi M., Bianchi M.E. (1996). The active gene that encodes human high mobility group 1 protein (HMG1) contains introns and maps to chromosome 13. Genomics. 35: 367—371. PMID 8661151 DOI:10.1006/geno.1996.0369
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yuan F., Gu L., Guo S., Wang C., Li G.M. (2004). Evidence for involvement of HMGB1 protein in human DNA mismatch repair. J. Biol. Chem. 279: 20935—20940. PMID 15014079 DOI:10.1074/jbc.M401931200
  • DeMarco R.A., Fink M.P., Lotze M.T. (2005). Monocytes promote natural killer cell interferon gamma production in response to the endogenous danger signal HMGB1. Mol. Immunol. 42: 433—444. PMID 15607795 DOI:10.1016/j.molimm.2004.07.023
  • Bell C.W., Jiang W., Reich C.F., Pisetsky D.S. (2006). The extracellular release of HMGB1 during apoptotic cell death. Am. J. Physiol. 291: C1318—C1325. PMID 16855214 DOI:10.1152/ajpcell.00616.2005

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4983 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 27 лютого 2017.
  4. UniProt, P09429 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 27 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]